Varetektsfengslede kan utvikle isolasjonsskader, depresjoner, søvnproblemer og andre bekymringer som følger av situasjonen de er i. Det kan medføre både fysiske og psykiske helseutfordringer som den kommunale helse- og omsorgstjenesten må være oppmerksomme på. De fleste selvmord i fengsel skjer i varetekt, svært tidlig etter innsettelse. Utvikling av psykose som en del av abstinens er ikke sjelden i varetekt.
For å avdekke akutte helsebehov bør den kommunale helse- og omsorgstjenesten gjennomføre innkomstsamtalen med varetektsfengslede slik det gjøres med domfelte (se eget råd om innkomstsamtale).
Den kommunale helse- og omsorgstjenesten må være oppmerksomme på at varetektsfengslede kan løslates på kort varsel. Det kan være hensiktsmessig å spørre innsatte om samtykke til å oppheve taushetsplikt overfor aktuelle samarbeidspartnere slik at informasjon (eventuelt) kan utveksles etter løslatelse.